Zawartość
- Ogólna ekstrakcja DNA
- Komórki roślinne i zwierzęce
- Ekstrakcja DNA roślin
- Ekstrakcja DNA zwierząt
- Różnice DNA
Struktura dwuniciowego DNA jest uniwersalna we wszystkich żywych komórkach, ale występują różnice w metodach ekstrakcji genomowego DNA z komórek zwierzęcych i roślinnych. Chociaż genomowy DNA żyje w jądrze komórkowym, ilość i czystość ekstrahowanego DNA zależy od rodzaju i wielkości komórki. Na przykład niektóre komórki zawierają więcej DNA i zanieczyszczeń niż inne. Czytaj dalej, aby dowiedzieć się więcej o różnicach w ekstrakcji DNA.
Ogólna ekstrakcja DNA
Jeśli potraktujesz komórki roślinne i zwierzęce substancją mydlaną, spowoduje to degradację lipidów w komórce i błonach jądrowych. Następnie mieszanina DNA oddzieli się od błon komórkowych i białek. Następnie możesz użyć alkoholu do wytrącenia DNA w roztworze. W zależności od ilości w próbce DNA może być widoczne gołym okiem. Należy jednak pamiętać, że ta prosta procedura niekoniecznie wytwarza DNA o wysokiej czystości.
Komórki roślinne i zwierzęce
Komórki roślinne różnią się od komórek zwierzęcych ze względu na ich sztywną ścianę komórkową i organelle, takie jak chloroplast. Zawierają również białka i enzymy, które odgrywają rolę w fotosyntezie. Niektóre komórki roślinne mają poliploidalność, co oznacza, że mają więcej niż jedną kopię każdego chromosomu na komórkę. Ponadto procesy komórkowe zachodzące w roślinach, takie jak fotosynteza, wytwarzają szereg metabolitów wtórnych. Komórki zwierzęce nie mają ściany komórkowej, ale nadal potrzebują substancji chemicznych, takich jak dodecylosiarczan sodu (SDS), aby rozerwać błonę komórkową i uwolnić genomowy DNA.
Ekstrakcja DNA roślin
Genomowe DNA roślin jest trudniejsze do wyodrębnienia ze względu na ścianę komórkową rośliny. Możesz go usunąć przez homogenizację lub dodanie celulazy w celu degradacji celulozy, która tworzy ścianę komórkową. Ponadto metabolity obecne w komórce roślinnej mogą zakłócać ekstrakcję genomowego DNA poprzez zanieczyszczenie próbki DNA podczas procesu wytrącania.
Ekstrakcja DNA zwierząt
Leukocyty krwi obwodowej są głównym źródłem genomowego DNA zwierząt, ale pobieranie próbek jest trudne, ponieważ krew musi pochodzić bezpośrednio od zwierzęcia. Krew zawiera szereg związków, takich jak białka, lipidy, białe krwinki, czerwone krwinki, płytki krwi i osocze, które mogą zanieczyścić próbkę DNA. Jednak podstawowym zanieczyszczeniem DNA zwierzęcego ekstrahowanym z próbek krwi jest hem, który jest niebiałkowym składnikiem hemoglobiny.
Różnice DNA
Różnice między DNA roślinnym i zwierzęcym leżą w sekwencji zasad w helisie. Związki znajdujące się w komórkach roślinnych nie występują w komórkach zwierzęcych, a sekwencje zasad DNA odzwierciedlają to. Ponadto genomowe DNA roślin jest często większe niż DNA zwierząt. Różnice te wpływają również na metody ekstrakcji, wydajność i czystość DNA.