Zawartość
- TL; DR (Too Long; Didnt Read)
- Opis rybosomów
- Występowanie rybosomów
- Rybosomy to fabryki białek
- Kto odkrył rybosomy?
- Odkrycie struktury rybosomu
- Co to jest rybozym?
- Kategoryzacja rybosomów według wartości Svedberga
- Znaczenie struktury rybosomu
Rybosomy są znane jako twórcy białek wszystkich komórek. Białka kontrolują i budują życie.
Dlatego rybosomy są niezbędne do życia. Pomimo ich odkrycia w latach 50. XX wieku, naukowcy naprawdę wyjaśnili strukturę rybosomów.
TL; DR (Too Long; Didnt Read)
Rybosomy, znane jako fabryki białek wszystkich komórek, po raz pierwszy odkrył George E. Palade. Jednak strukturę rybosomów określiły dekady później Ada E. Yonath, Thomas A. Steitz i Venkatraman Ramakrishnan.
Opis rybosomów
Rybosomy mają swoją nazwę od „ribo” kwasu rybonukleinowego (RNA) i „soma”, co po łacinie oznacza „ciało”.
Naukowcy definiują rybosomy jako strukturę występującą w komórkach, nazywaną jednym z kilku mniejszych podzbiorów komórkowych organelle. Rybosomy mają dwie podjednostki, jedną dużą i jedną małą. Jądro tworzy te podjednostki, które się blokują. Rybosomalny RNA i białka (ryboproteiny) tworzą rybosom.
Niektóre rybosomy unoszą się w cytoplazmie komórki, podczas gdy inne przyczepiają się do retikulum endoplazmatycznego (ER). Nazywa się retikulum endoplazmatyczne wysadzane rybosomami szorstka siateczka śródplazmatyczna (RER); gładka retikulum endoplazmatyczne (SER) nie ma dołączonych rybosomów.
Występowanie rybosomów
W zależności od organizmu komórka może mieć kilka tysięcy a nawet milionów rybosomów. Rybosomy występują zarówno w komórkach prokariotycznych, jak i eukariotycznych. Można je również znaleźć w bakteriach, mitochondriach i chloroplastach. Rybosomy są bardziej rozpowszechnione w komórkach, które wymagają stałej syntezy białek, takich jak komórki mózgu lub trzustki.
Niektóre rybosomy mogą być dość masywne. U eukariontów mogą mieć 80 białek i być zbudowane z kilku milionów atomów. Ich część RNA zajmuje więcej masy niż część białka.
Rybosomy to fabryki białek
Rybosomy biorą kodony, które są serią trzech nukleotydów, z informacyjnego RNA (mRNA). Kodon służy jako matryca z DNA komórki do wytworzenia określonego białka. Rybosomy następnie tłumaczą kodony i dopasowują je do aminokwasu z przenieść RNA (tRNA). Jest to znane jako tłumaczenie.
Rybosom ma trzy miejsca wiązania tRNA: an aminoacyl miejsce wiązania (miejsce) do przyłączania aminokwasów, peptydyl strona (strona P) i an wyjście strona (strona E).
Po tym procesie przetłumaczony aminokwas opiera się na łańcuchu białkowym zwanym a polipeptyd, dopóki rybosomy nie zakończą pracy nad wytworzeniem białka. Po uwolnieniu polipeptydu do cytoplazmy staje się funkcjonalnym białkiem. W tym procesie rybosomy są często definiowane jako fabryki białek. Trzy etapy produkcji białka nazywane są inicjacją, wydłużeniem i translacją.
Te podobne do mechanicznych rybosomy działają szybko, w niektórych przypadkach przylegając do 200 aminokwasów na minutę; prokariota mogą dodawać 20 aminokwasów na sekundę. Złożone białka zajmują kilka godzin. Rybosomy wytwarzają większość z około 10 miliardów białek w komórkach ssaków.
Ukończone białka mogą z kolei ulegać dalszym zmianom lub fałdowaniu; to się nazywa modyfikacja potranslacyjna. U eukariontów Aparat Golgiego uzupełnia białko przed jego uwolnieniem. Gdy rybosomy zakończą pracę, ich podjednostki zostaną poddane recyklingowi lub rozmontowane.
Kto odkrył rybosomy?
George E. Palade po raz pierwszy odkrył rybosomy w 1955 roku. Opis rybosomu Palade przedstawił je jako cząstki cytoplazmatyczne, które związane są z błoną siateczki endoplazmatycznej. Palade i inni badacze odkryli funkcję rybosomów, którą była synteza białek.
Francis Crick stworzyłby dalej centralny dogmat biologii, który podsumował proces budowania życia jako „DNA wytwarza RNA z białka”.
Chociaż ogólny kształt określono za pomocą obrazów mikroskopowych elektronowych, zajęłoby to jeszcze kilka dekad, aby ustalić rzeczywistą strukturę rybosomów. Było to w dużej mierze spowodowane względnie ogromnym rozmiarem rybosomów, co hamowało analizę ich struktury w postaci krystalicznej.
Odkrycie struktury rybosomu
Podczas gdy Palade odkrył rybosom, inni naukowcy ustalili jego strukturę. Trzej odrębni naukowcy odkryli strukturę rybosomów: Ada E. Yonath, Venkatraman Ramakrishnan i Thomas A. Steitz. Ci trzej naukowcy zostali nagrodzeni Nagrodą Nobla w dziedzinie chemii w 2009 roku.
Odkrycie trójwymiarowej struktury rybosomu miało miejsce w 2000 r. Urodzona w 1939 r. Yonath otworzyła drzwi dla tego objawienia. Początkowe prace nad tym projektem rozpoczęły się w latach 80. Używała drobnoustrojów z gorących źródeł do izolowania ich rybosomów, ze względu na ich solidną naturę w trudnych warunkach. Była w stanie krystalizować rybosomy, aby można je było analizować za pomocą krystalografii rentgenowskiej.
To wygenerowało wzór kropek na detektorze, aby można było wykryć pozycje atomów rybosomalnych. Yonath ostatecznie wytworzył wysokiej jakości kryształy za pomocą kriokrystalografii, co oznacza, że kryształy rybosomalne zostały zamrożone, aby zapobiec ich rozpadowi.
Następnie naukowcy próbowali wyjaśnić „kąt fazowy” wzorów kropek. W miarę poprawy technologii udoskonalenia procedury doprowadziły do uszczegółowienia na poziomie pojedynczego atomu. Urodzony w 1940 r. Steitz był w stanie odkryć, które etapy reakcji obejmowały poszczególne atomy na połączeniach aminokwasów. Informacje o fazie dla większej jednostki rybosomu znalazł w 1998 roku.
Ramakrishan, urodzony w 1952 r., Z kolei pracował nad rozwiązaniem fazy dyfrakcji promieni rentgenowskich w celu uzyskania dobrej mapy molekularnej. Znalazł informację o fazie dla mniejszej podjednostki rybosomu.
Obecnie dalsze postępy w pełnej krystalografii rybosomów doprowadziły do lepszej rozdzielczości struktur złożonych rybosomów. W 2010 r. Naukowcy z powodzeniem skrystalizowali eukariotyczne rybosomy 80S Saccharomyces cerevisiae i byli w stanie zmapować jego strukturę rentgenowską („80S” jest rodzajem kategoryzacji zwanej wartością Svedberga; więcej na ten temat wkrótce). To z kolei doprowadziło do uzyskania dodatkowych informacji na temat syntezy i regulacji białek.
Udowodniono, że rybosomy mniejszych organizmów są najłatwiejsze do określenia struktury rybosomu. Jest tak, ponieważ same rybosomy są mniejsze i mniej złożone. Potrzebne są dalsze badania, aby pomóc określić struktury rybosomów organizmów wyższych, takich jak u ludzi. Naukowcy mają również nadzieję dowiedzieć się więcej o rybosomalnej strukturze patogenów, aby pomóc w walce z chorobami.
Co to jest rybozym?
Termin rybozym odnosi się do większej z dwóch podjednostek rybosomu. Rybozym działa jako enzym, stąd jego nazwa. Służy jako katalizator w tworzeniu białka.
Kategoryzacja rybosomów według wartości Svedberga
Wartości Svedberga (S) opisują szybkość sedymentacji w wirówce. Naukowcy często opisują jednostki rybosomalne przy użyciu wartości Svedberga. Na przykład prokarioty posiadają rybosomy 70S, które składają się z jednej jednostki z 50S i jednej z 30S.
Nie sumują się one, ponieważ szybkość sedymentacji ma więcej wspólnego z rozmiarem i kształtem niż z masą cząsteczkową. Z kolei komórki eukariotyczne zawierają rybosomy 80S.
Znaczenie struktury rybosomu
Rybosomy są niezbędne dla każdego życia, ponieważ wytwarzają białka, które zapewniają życie i jego elementy składowe. Niektóre niezbędne białka dla ludzkiego życia obejmują między innymi hemoglobinę w czerwonych krwinkach, insulinę i przeciwciała.
Kiedy naukowcy odsłonili strukturę rybosomów, otworzyli nowe możliwości eksploracji. Jedną z takich możliwości poszukiwania są nowe antybiotyki. Na przykład nowe leki mogą zatrzymać chorobę, celując w niektóre elementy strukturalne rybosomów bakterii.
Dzięki strukturze rybosomów odkrytych przez Yonatha, Steitza i Ramakrishnana badacze znają teraz dokładne lokalizacje między aminokwasami i lokalizacje, w których białka opuszczają rybosomy. Zerowanie w miejscu, w którym antybiotyki przyczepiają się do rybosomów, otwiera znacznie większą precyzję działania leku.
Ma to kluczowe znaczenie w epoce, w której dawniej oporne antybiotyki spotkały się z odpornymi na antybiotyki szczepami bakterii. Odkrycie struktury rybosomu ma zatem ogromne znaczenie dla medycyny.