Zawartość
W XIX wieku taksonomia - klasyfikacja organizmów żywych - była w biologii bardzo popularna. Zarówno amatorzy, jak i zawodowi przyrodnicy byli tak pochłonięci szaleństwem zbierania i identyfikowania stworzeń, że rzadkie chrząszcze były gorącymi towarami. W tym czasie niewiele było wiadomo o mikroorganizmach i ich miejscu w świecie żywych stworzeń, a klasyfikacja mikrobiologii nie wzbudziła tyle uwagi. W ciągu dziesięcioleci nastąpił gwałtowny wzrost wiedzy o drobnoustrojach i metodach identyfikacji mikroorganizmów, przy czym część tego wzrostu wykazała skuteczna klasyfikacja mikroorganizmów.
Składniki taksonomii
Taksonomia składa się z trzech elementów: nomenklatury, klasyfikacji i identyfikacji. Nomenklatura to po prostu przypisanie nazwy gatunkowi. Klasyfikacja polega na grupowaniu gatunków według wspólnych cech - niektóre z nich są fizyczne, a niektóre biochemiczne. Identyfikacja wykorzystuje cechy organizmu w celu ustalenia, gdzie należy on do schematu klasyfikacji. Nowoczesny system taksonomiczny ma swoją największą, najbardziej integracyjną grupę, domeny. Najmniejsza grupa to gatunek. Poziomy, od najbardziej włączających do najbardziej szczegółowych, przebiegają tak: domena, królestwo, typ, klasa, porządek, rodzina, rodzaj i gatunek. Na przykład jesteś Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.
Mikroorganizmy i domeny
Mikroorganizmy są niezwykle różnorodne. Nie są zdefiniowane przez żaden szczególny rodzaj struktury lub funkcji, ale po prostu przez ich rozmiar. Mikroorganizmy są tak różnorodne, że mieszczą się we wszystkich trzech różnych klasyfikacjach najwyższego poziomu - we wszystkich trzech domenach. Jedna domena to bakterie, druga to archeony, a ostatnia to eukaria. Wszyscy członkowie domen bakterii i archeonów są jednokomórkowymi mikroorganizmami. Są to obie komórki bez membran oddzielających materiał genetyczny od reszty komórki - błony, które definiują jądro. Zatem wszystkie królestwa, typy, klasy, zakony, rodziny, rodzaje i gatunki w domenach bakterii i archeonów są mikroorganizmami.
Jednokomórkowe protisty
Eukaria to organizmy, których komórki zawierają jądro. Wiele organizmów eukariotycznych to mikroorganizmy jednokomórkowe, ale wiele innych - takich jak sekwoje lub ty - nie jest. Konieczne są więc dodatkowe klasyfikacje. Królestwo Protista w domenie Eukarya składa się tylko z jednokomórkowych mikroorganizmów. Protisty dzielą się na trzy różne grupy typów: cztery różne rodzaje alg, cztery różne rodzaje pierwotniaków i dwie różne rodzaje pleśni. Ale wszystkie organizmy w obrębie tej phyli - wszystkie w królestwie Protista - są mikroorganizmami.
Mikroskopijne Grzyby
Królestwo grzybów jest zawarte w domenie Eukarya. Niektóre rodzaje grzybów w grzybach zawierają mikroorganizmy. Na przykład rodzaj Zygomycota zawiera mikroskopijne formy do chleba, a typ Ascomycota zawiera drożdże oraz szkodniki i pasożyty uprawne przez drobnoustroje. Porosty to symbiotyczne połączenie grzyba i organizmu fotosyntetycznego - zawarte częściowo w królestwie Grzybów, a częściowo w innych królestwach, a nawet w innych domenach.